رييس سازمان بالاترين مقام اجرايي سازمان است كه توسط وزير معادن و فلزات منصوب ميشود و باري اداره امور مالي، اداري، استخدامي، فني وكليه وظايف مربوط به سازمان در حدود قوانين و مقررات مربوط داراي اختيارات لازم ميباشد.